Kluczowa różnica między metabolizmem a trawieniem polega na tym, że metabolizm to kompletny zestaw reakcji biochemicznych zachodzących w organizmie, podczas gdy trawienie to rozkład dużych nierozpuszczalnych cząsteczek pokarmu na małe cząsteczki, które mogą zostać wchłonięte do krwiobiegu.
Zarówno metabolizm, jak i trawienie są ważnymi procesami zachodzącymi w żywych organizmach. Jak wspomniano powyżej, metabolizm odnosi się do całego zestawu reakcji chemicznych i fizjologicznych zachodzących w żywym organizmie, w tym w zwierzętach i roślinach. Trawienie, czyli rozkład pokarmu, jest również częścią metabolizmu.