Kluczową różnicą między estrem a eterem jest to, że grupą funkcyjną estru jest –COO, podczas gdy grupą funkcyjną eteru jest –O-.
Ester i eter to organiczne cząsteczki z atomami tlenu. Estry mają grupę –COO. Tutaj jeden atom tlenu jest połączony z węglem podwójnym wiązaniem, a drugi tlen jest związany wiązaniem pojedynczym. Ponieważ tylko trzy atomy łączą się z atomem węgla, wokół niego jest trójkątna płaska geometria. Ponadto, atom węgla sp 2 hybrydyzuje. Ponadto ester jest pochodną kwasu karboksylowego. Z drugiej strony eter ma atom tlenu z dwoma pojedynczymi wiązaniami z dwoma grupami alkilowymi lub arylowymi. Atom tlenu ma również dwie samotne pary elektronów.
