Kluczowa różnica między opsonizacją a neutralizacją polega na sposobie, w jaki wywołują odpowiedź immunologiczną. W przypadku opsonizacji patogeny są znakowane przed zniszczeniem, podczas gdy w przypadku neutralizacji działanie patogenu jest neutralizowane.
Odpowiedzi immunologiczne mogą być wrodzone lub adaptacyjne. Patogeny posiadają receptory rozpoznające patogeny, co ułatwia ich identyfikację przez gospodarza. Podczas opsonizacji gospodarz wytwarza opsoniny. Jednak podczas neutralizacji gospodarz wytwarza przeciwciała neutralizujące, aby zneutralizować efekt reakcji przeciwciało-antygen.
