Kluczowa różnica między substancjami organicznymi i nieorganicznymi polega na tym, że wszystkie substancje organiczne zawierają węgiel jako podstawowy składnik, podczas gdy substancje nieorganiczne mogą zawierać węgiel lub nie.
W większości przypadków substancje organiczne zawierają węgiel, wodór, a czasem tlen, wraz z wiązaniami CH. Jednak większość związków nieorganicznych nie zawiera węgla, z wyjątkiem niektórych substancji, takich jak węglany i cyjanki, które ze względów historycznych są klasyfikowane jako nieorganiczne (wcześniej naukowcy określali te związki jako nieorganiczne). Dlatego główna różnica między substancjami organicznymi i nieorganicznymi polega na składzie chemicznym substancji.