Kluczowa różnica między przejściowym a zrównoważonym polimorfizmem polega na tym, jak zachowują się allele. Polimorfizm przejściowy to postępujące zastępowanie jednego allelu genu innym allelem, podczas gdy zrównoważony polimorfizm polega na utrzymywaniu w czasie dwóch różnych alleli genu
Polimorfizm genetyczny to jeden lub dwa lub więcej wariantów określonego DNA. Polimorfizm przejściowy i zrównoważony to dwa typy polimorfizmu, które powstają z powodu dwóch alternatywnych alleli genu. W polimorfizmie przejściowym, z dwóch alternatywnych alleli danego locus, jeden allel jest stopniowo zastępowany przez inny. W zrównoważonym polimorfizmie oba allele są ze sobą w równowadze. Obie wersje genu są utrzymywane w populacji.
