Kluczową różnicą między ogniskowaniem chromatograficznym a ogniskowaniem izoelektrycznym jest to, że chromatofokusowanie jest rodzajem metody chromatografii kolumnowej, która wykorzystuje żywice jonowymienne, podczas gdy ogniskowanie izoelektryczne jest rodzajem techniki elektroforezy, która wykorzystuje unieruchomione żele gradientowe pH.
Ogniskowanie chromatofokusowe i ogniskowanie izoelektryczne to dwie techniki, które rozdzielają białka według ich punktów izoelektrycznych. Ogniskowanie chromatofokusowe i izoelektryczne ma dużą zdolność rozdzielczą. Chromatofokusowanie jest metodą chromatografii kolumnowej o wysokiej rozdzielczości, podczas gdy ogniskowanie izoelektryczne jest metodą rozdziału elektroforetycznego. Co więcej, ogniskowanie chromatograficzne nie wykorzystuje pola elektrycznego, podczas gdy ogniskowanie izoelektryczne wymaga pola elektrycznego.
