Kluczowa różnica - Metabolomika a Metabonomika
Metabolity to małe cząsteczki biorące udział w reakcjach metabolicznych w komórkach. Metabolity obejmują metaboliczne półprodukty, hormony, wtórne metabolity, cząsteczki sygnałowe itp. Są to cząsteczki funkcjonujące w reakcjach biochemicznych komórek. Kompletny zestaw metabolitów próbki biologicznej lub pojedynczego organizmu jest nazywany metabolomem. Metabolome to dynamiczna kolekcja, która zmienia się w organizmie co sekundę. Metabolomika i metabonomika to dwa terminy związane z badaniem metabolomu organizmu. Kluczowa różnica między metabolomiką a metabolomiką polega na tym, że metabolomika bardziej interesuje się prawidłowym endogennym metabolizmem i profilowaniem metabolicznym na poziomie komórkowym lub narządowym, podczas gdy metabolomika bardziej koncentruje się na rozszerzeniu profilu metabolicznego o informacje o zaburzeniach metabolizmu spowodowanych czynnikami środowiskowymi, chorobami, jelitami mikroorganizmy i porównywanie profili metabolicznych itp. Metabolomika jest napędzana głównie przez spektrometrię mas, a metabonomia wykorzystuje spektroskopię NMR do analizy metabolitów.
SPIS TREŚCI
1. Omówienie i kluczowe różnice
2. Czym jest metabolomika
3. Co to jest metabonomika
4. Porównanie obok siebie - metabolomika a metabolomika
5. Podsumowanie
Co to jest metabolomika?
Metabolomika to nauka o procesach metabolicznych zachodzących w komórkach, płynach biologicznych, tkankach lub organizmach. Obejmuje identyfikację i kwantyfikację metabolitów komórkowych przy użyciu dobrych narzędzi analitycznych i statystycznych. Metabolomika jest uważana za ważne badanie, ponieważ ujawnia informacje o metabolizmie organizmu.
Do badania substratów i produktów reakcji metabolicznych metabolomika wykorzystuje spektrometrię mas jako platformę analityczną. Spektrometria mas ujawnia rodzaje metabolitów i ich stężenia, odzwierciedlając rzeczywisty stan biochemiczny komórek lub tkanek. Stąd metabolomikę można uznać za najlepszy reprezentant molekularnego fenotypu organizmu. Metabolomika jest omową technologią małych cząsteczek organizmów i jest porównywana z innymi badaniami omowymi; metabolomika jest bardzo ważna, ponieważ bezpośrednio odzwierciedla aktualny stan reakcji biochemicznej komórek.
Metabolomikę można również uważać za rozszerzenie proteomiki, ponieważ są one generowane w wyniku aktywności enzymów, które są białkami, jak pokazano na poniższym rysunku.
Rysunek 01: Schemat metabolomiki
Co to jest metabonomika?
Metabonomię definiuje się jako ilościowy pomiar wieloparametrowych odpowiedzi metabolicznych w określonym czasie w odniesieniu do stresów patofizjologicznych lub modyfikacji genetycznych. Zwykle odnosi się to do badań prowadzonych na temat odżywiania ludzi i odpowiedzi na leki lub choroby. Podejście to zostało zapoczątkowane przez Jeremy'ego Nicholsona z Imperial College w Londynie i było stosowane w wielu dziedzinach, w tym w toksykologii, diagnozowaniu chorób, żywieniu itp. Historycznie, metabonomia była jedną z pierwszych metod zastosowania zakresu biologii systemów do badań. metabolizmu.
Metabonomics bardziej interesuje się porównaniem profili biochemicznych niż identyfikacją poszczególnych związków metabolicznych w metabolomice. Dlatego metabonomikę można zdefiniować jako podzbiór metabolomiki. Podkreśla głównie porównanie profili metabolicznych różnych populacji w odniesieniu do chorób, stresów środowiskowych, modyfikacji genetycznych, odżywiania, leków itp., Ponieważ metabolity są dobrymi markerami, które sygnalizują stan chorobowy, skutki leków, stres środowiskowy, narażenie na toksyny itp.
Badania metabonomiczne ujawniają metabolity zarówno wewnątrzkomórkowe, jak i zewnątrzkomórkowe. Wykorzystuje techniki o dużej przepustowości do jednoczesnej i wielokrotnej analizy ogromnej liczby metabolitów, umożliwiając tymczasowe badanie stanu fizjologicznego komórek. Ujawnia również korelację między metabolitami a stanem patologicznym organizmu. Aby wesprzeć badania metabonomiczne, można zastosować genomikę i proteomikę, ponieważ są one ze sobą powiązane, jak pokazano na powyższym rysunku.
Jaka jest różnica między metabolomiką a metabolomiką?
Porównaj środek artykułu przed tabelą
Metabolomika a Metabonomika |
|
| Metabolomika to badanie pełnego zestawu metabolitów organizmu | Metabonomika to ilościowe badanie wieloparametrowych odpowiedzi metabolicznych żywych systemów w ujęciu czasowym na patofizjologiczne bodźce lub modyfikacje genetyczne. |
| Główna obawa | |
| Metabolomika bardziej zajmuje się profilowaniem metabolicznym i identyfikacją poszczególnych metabolitów obecnych w komórkach. | Metabonomika bardziej zajmuje się porównywaniem metabolitów lub profili metabolicznych populacji w odniesieniu do modyfikacji genetycznych, chorób, stresów środowiskowych, bodźców patologicznych, leków itp. |
| Informacja | |
| Metabolomika koncentruje się głównie na metabolizmie endogennym. | Metabonomika nie ogranicza się do metabolizmu endogennego. Poszerza się o znalezienie informacji o zaburzeniach metabolizmu spowodowanych czynnikami wewnętrznymi i zewnętrznymi, takimi jak wzorce żywieniowe, toksyny, procesy chorobowe itp. |
| Narzędzia analityczne | |
| Wykorzystuje spektrometrię mas jako podstawową platformę analityczną | Metabonomics wykorzystuje spektroskopię NMR jako główną platformę analityczną. |
Podsumowanie - Metabolomika a Metabonomika
Metabolom reprezentuje pełny zestaw małych cząsteczek zwanych metabolitami, występujących w komórce lub w organizmie. Metabolomika to badanie całego metabolomu w celu wygenerowania profilu metabolicznego. Metabolomika pozwala naukowcom mierzyć rzeczywisty stan fizjologiczny komórki lub organizmu. Metabonomika jest częścią metabolomiki, która rozciąga się na wydobywanie informacji o wieloparametrowych odpowiedziach metabolicznych organizmów żywych na bodźce patofizjologiczne i modyfikacje genetyczne. Metabonomika nie zajmuje się tylko indywidualnym profilowaniem metabolicznym, takim jak metabolomika; porównuje profile metaboliczne w odniesieniu do innych czynników, takich jak stresy środowiskowe, choroby, toksyny itp. Zarówno metabolomika, jak i metabonomika obejmują badania metabolitów organizmów, aby zmierzyć rzeczywisty stan fizjologiczny komórek. W związku z tym,czasami te dwa są uważane za synonimy, bez uwzględnienia różnicy między metabolomiką a metabonomiką.
