Kluczowa różnica między zakażeniem krzyżowym a zakażeniem wtórnym polega na tym, że zakażenie krzyżowe oznacza przenoszenie szkodliwych mikroorganizmów od innej osoby, sprzętu medycznego lub narzędzi, podczas gdy zakażenie wtórne to zakażenie, które występuje podczas lub po leczeniu innego zakażenia.
Infekcjom można zapobiegać, utrzymując czyste i dokładnie odkażone obszary wokół pacjentów. Dlatego lekarze często myją ręce. Ponadto wewnątrz szpitali utrzymywane są sterylne środowiska. Infekcja krzyżowa i infekcja wtórna to dwa rodzaje infekcji, przed którymi należy chronić pacjentów.