Kluczową różnicą między aglutynogenami a aglutyninami jest to, że aglutynogeny to wszelkiego rodzaju antygeny lub ciała obce, które aktywują wytwarzanie przeciwciał aglutyniny, podczas gdy aglutyniny są przeciwciałami wytwarzanymi przez nasz układ odpornościowy przeciwko antygenom.
Aglutynacja to proces tworzenia agregacji w wyniku połączenia przeciwciał z antygenami. Obejmuje dwa kroki; początkowe wiązanie lub uczulenie i tworzenie sieci. Jest to rodzaj odpowiedzi immunologicznej mającej na celu usunięcie chorobotwórczych drobnoustrojów i substancji z naszego organizmu. Aglutynacja służy do wykrywania grup krwi i innych patologicznych jednostek.