Kluczową różnicą między chromatydami siostrzanymi a chromatydami niesiostrowymi jest to, że chromatydy siostrzane są identyczne i zawierają ten sam allel w tych samych loci, podczas gdy chromatydy niesiostrowe nie są identyczne i zawierają różne allele tego samego genu w tych samych loci.
Dwa rodzaje chromatyd występujące w komórkach, które ulegają podziałowi komórkowemu, to chromatydy siostrzane i chromatydy niepsiaste. Ogólnie chromatydy powstają we wczesnych stadiach podziału komórkowego. Z drugiej strony podczas metafazy I mejozy tworzą się niesisteryjne chromatydy. Są obecne w homologicznej parze chromosomów na równiku komórkowym, podczas gdy chromatydy siostrzane są obecne w tym samym chromosomie. Ponadto centromer chromosomu łączy razem dwie siostrzane chromatydy.
