Kluczowa różnica między dyneiną a kinezyną polega na tym, że dyneina jest białkiem motorycznym cytoszkieletu, które porusza się w kierunku końca ujemnego mikrotubul, podczas gdy kinezyna jest kolejnym białkiem motorycznym cytoszkieletu, które przemieszcza się w kierunku dodatniego końca mikrotubul.
Cytoszkielet składa się z różnych rodzajów włókien. Jednym z typów są mikrotubule. Kierują ruchem materialnym w komórce. Są również ważne w utrzymaniu kształtu komórki. Poza tym mikrotubule są niezbędne do oddzielania chromosomów w mitozie i mejozie. Ponadto mikrotubule są kluczowymi składnikami rzęsek i wici niektórych komórek eukariotycznych. Strukturalnie mikrotubule są strukturami polarnymi. Mają koniec plus i koniec minus. Ogólnie koniec ujemny rozciąga się w kierunku środka komórki, podczas gdy koniec dodatni rozciąga się w kierunku powierzchni komórki. Podczas transportu wewnątrzkomórkowego pęcherzyków i organelli dwa rodzaje białek motorycznych cytoszkieletu pomagają mikrotubulom. Są to dyneiny i kinezyny. Dyneiny przemieszczają się w kierunku ujemnego końca mikrotubul, przenosząc materiały do środka komórki. W przeciwieństwie do tego kinezyny przemieszczają się w kierunku powierzchni komórki, przenosząc materiały na obrzeża komórki.