Kluczową różnicą między GFP i EGFP jest to, że GFP jest białkiem typu dzikiego włączonym do klonowania molekularnego komórek innych niż ssaki, podczas gdy EGFP jest ulepszonym lub zmodyfikowanym typem GFP, który można stosować na komórkach ssaków.
Klonowanie molekularne to zaawansowana technika, którą naukowcy niezmiernie wykorzystują do ekspresji białek za pomocą technologii rekombinacji. W technologii rekombinacji DNA konieczna jest pomyślna transformacja rekombinowanego wektora do organizmu gospodarza. Dlatego podczas procesu transformacji należy zidentyfikować i potwierdzić, czy interesujący gen został transformowany na gospodarza, czy nie. Aby to ocenić, biolodzy molekularni stosują kilka technik. Jedną z tych technik jest gen reporterowy. Te geny reporterowe działają jako markery selekcyjne do selekcji właściwych transformantów. Zatem zielone białko fluorescencyjne (GFP) i wzmocnione zielone białko fluorescencyjne (EGFP) są dwoma białkami reporterowymi używanymi w klonowaniu molekularnym.
