Kluczowa różnica między immunosupresją a niedoborem odporności polega na tym, że immunosupresja odnosi się do obniżenia wydajności układu odpornościowego, podczas gdy niedobór odporności odnosi się do niezdolności układu odpornościowego do walki z czynnikami zakaźnymi.
Układ odpornościowy wykrywa szeroką gamę czynników zakaźnych dostających się do naszego organizmu i chroni nas przed chorobami. Dlatego jest to system obronny naszego organizmu. Składa się z różnych typów komórek odpornościowych. Układ odpornościowy działa za pośrednictwem dwóch podsystemów: układu odporności wrodzonej i układu odporności adaptacyjnej. U zdrowego człowieka układ odpornościowy działa normalnie i zapobiega występowaniu chorób. Ale kiedy występują zaburzenia w układzie odpornościowym, nie działa aktywnie. Niedobór odporności jest stanem, w którym zdolność układu odpornościowego do walki z chorobami staje się niska lub nie występuje; immunosupresja to kolejny stan związany z układem odpornościowym, w którym skuteczność układu odpornościowego spada.
