Kluczową różnicą między ubichinonami a cytochromami jest to, że ubichinony (CoQ) nie są białkami, podczas gdy cytochromy są białkami.
Łańcuch transportu elektronów jest ostatnim etapem oddychania tlenowego. Dlatego występuje w wewnętrznej błonie mitochondriów. Ponadto składa się z nośników elektronów, które ułatwiają wytwarzanie gradientu protonów w poprzek błony. Oprócz NAD i flawoprotein, ubichinony i cytochromy to dwa rodzaje nośników elektronów zaangażowanych w łańcuch transportu elektronów. Ubichinony to nierozpuszczalne w białkach hydrofobowe cząsteczki organiczne rozpuszczalne w tłuszczach, podczas gdy cytochromy to białka zawierające żelazo.
