Kluczowa różnica - RNASE A vs RNASE H
Rybonukleazy to nukleazy, które specyficznie rozkładają RNA na mniejsze jednostki. Można je podzielić na dwie kategorie; endorybonukleazy i egzorybonukleazy. Endorybonukleaza jest endonukleazą, która może degradować jednoniciowy lub dwuniciowy RNA. Rozszczepia wiązania fosfodiestrowe w łańcuchu polinukleotydowym RNA. Przykładami są RNaza A, RNaza III, RNaza T1, RNaza P i RNaza H. Egzorbonukleaza jest egzonukleazą, która degraduje RNA poprzez usuwanie końcowych nukleotydów z 5 'lub 3' końca cząsteczki RNA. Przykładami są RNaza R, RNaza II, RNaza D i RNaza PH. Kluczową różnicą między RNASE A i RNASE H jest to, że RNase A jest rybonukleazą trzustkową, która specyficznie rozkłada jednoniciowy RNA na mniejsze składniki, podczas gdy RNaza H jest niespecyficznym enzymem, który rozszczepia RNA w hybrydzie RNA-DNA na mniejsze jednostki poprzez mechanizm hydrolityczny.
ZAWARTOŚĆ
1. Przegląd i kluczowe różnice
2. Co to jest RNASE A
3. Co to jest RNASE H
4. Podobieństwa między RNASE A i RNASE H
5. Bezpośrednie porównanie - RNASE A vs RNASE H w formie tabelarycznej
6. Podsumowanie
Co to jest RNASE A?
RNaza A jest rybonukleazą trzustkową, która specyficznie rozszczepia niesparowane reszty cytozyny i uracylu na końcu 3 'jednoniciowego RNA. RNase H działa przy wyższym stężeniu soli (0,3 M lub wyższym stężeniu NaCl). Reakcja hydrolityczna składa się z dwóch etapów. Tworzy produkt 3 'fosforylowany poprzez półprodukt cykliczny monofosforan 2', 3 '. Chociaż jest specyficzny dla jednoniciowego RNA przy wyższym stężeniu soli, może również degradować dwuniciowy RNA i RNA w hybrydzie RNA-DNA przy niższym stężeniu NaCl (poniżej 0,3 M NaCl).
Bruce Merrifield jako pierwszy zsyntetyzował ten enzym. RNaza A to bardzo popularny enzym w badaniach molekularnych. RNaza A trzustki bydlęcej jest przykładem RNazy A. Jest to jeden z najtwardszych enzymów stosowanych w laboratorium. Enzym ten nie potrzebuje kofaktora do swojej aktywności. To wysoce termostabilny enzym. RNaza A jest pierwszym enzymem i trzecim białkiem, w którym wykryto prawidłową sekwencję aminokwasów. Ten enzym jest bardzo mały, ma 124 aminokwasy i masę cząsteczkową 12600da. Ma cztery reszty histydyny (His 12 i His 119, które biorą udział w reakcji katalitycznej).
Rysunek 01: RNase A
RNazę A można wyodrębnić przez gotowanie surowej próbki. Podczas wrzenia wszystkie inne enzymy degradują pozostałą RNazę A. RNaza A jest niezwykle stabilnym enzymem. Enzym ten hamuje przez białko inhibitora rybonukleazy, kompleksy metali ciężkich i wanadanu urydyny.
Co to jest RNase H?
RNaza H jest niespecyficznym enzymem rybonukleazy, który może degradować RNA w hybrydzie RNA-DNA poprzez reakcję hydrolityczną. RNaza H rozszczepia wiązanie 3 'OP RNA w hybrydzie RNA-DNA. Ostatecznie wytwarza produkty zakończone 3'OH i 5 'fosforanem. W replikacji DNA odgrywa kluczową rolę, usuwając starter RNA po utworzeniu nowych nici DNA. W warunkach laboratoryjnych specyficznie degraduje RNA w hybrydzie RNA-DNA, ale nie w DNA i niezhybrydyzowanym RNA. Enzym ten jest zwykle używany do niszczenia matrycy RNA po utworzeniu pierwszej komplementarnej nici DNA podczas syntezy cDNA.
Rysunek 02: RNase H
RNase H jest również stosowana w testach ochrony przed nukleazami. Można go również włączyć do usuwania ogona poli A z mRNA. RNase H ma zdolność niszczenia niekodującego RNA wewnątrz i na zewnątrz komórki. Jony metali są wymagane jako kofaktory dla tej aktywności białka. Do hamowania enzymu RNase H. można zastosować chelator (EDTA).
Jakie są podobieństwa między RNASE A i RNASE H?
- Obie mają naturę białkową.
- Obie są endorybonukleazą
- Obie mogą degradować RNA.
- Obie przeprowadzają reakcje hydrolityczne.
- Laboratoria molekularne używają obu.
Jaka jest różnica między RNASE A i RNASE H?
Porównaj środek artykułu przed tabelą
RNASE A vs RNASE H |
|
| RNaza A jest rybonukleazą trzustkową, która specyficznie rozszczepia koniec 3 'niesparowanych reszt cytozyny i uracylu jednoniciowego RNA przy wyższym stężeniu soli. | RNaza H jest niespecyficznym enzymem rybonukleazy, który może degradować RNA w hybrydzie RNA-DNA poprzez reakcję hydrolityczną. |
| Charakter rozszczepiania RNA | |
| RNaza A specyficznie rozszczepia jednoniciowy RNA przy wyższym stężeniu soli. | RNaza H rozszczepia RNA w hybrydzie RNA-DNA. |
| Potrzeba kofaktorów do działania | |
| RNaza A nie potrzebuje kofaktorów do swojej aktywności. | RNase H potrzebuje jonów metali jako kofaktorów do swojej aktywności. |
| Inhibitory aktywności białek | |
| Białko inhibitora rybonukleazy, kompleksy metali ciężkich i wanadanu urydyny hamują aktywność RNAzy A. | Chelator (EDTA) hamuje aktywność RNazy H. |
| Usuwanie startera RNA w replikacji DNA | |
| RNaza A nie jest używana do usuwania starterów RNA w replikacji DNA. | RNase H służy do usuwania starterów RNA w replikacji DNA |
| Usuwanie szablonu DNA w syntezie dopełniającej DNA (C-DNA) | |
| RNaza A nie jest używana do usuwania matrycy RNA podczas syntezy komplementarnego DNA (C-DNA). | RNase H służy do usuwania matrycy RNA podczas syntezy komplementarnego DNA (C-DNA). |
| Usunięcie ogona Poly-A w mRNA zhybrydyzowanym z Oligo (dt) | |
| RNase A nie jest używana do usuwania „ogona poli-A” w mRNA zhybrydyzowanym z oligo (dt). | RNase H służy do usuwania „ogona poli-A” w mRNA zhybrydyzowanym z oligo (dt) |
Podsumowanie - RNASE A vs RNASE H
Rybonukleazy to enzymy nukleazy, które mają zdolność rozszczepiania RNA na mniejsze jednostki. Są dwa rodzaje; endorybonukleazy i egzorybonukleazy. Endorybonukleaza jest endonukleazą, która ma zdolność degradacji jednoniciowego lub dwuniciowego RNA. I rozszczepia wiązanie fosfodiestrowe w łańcuchu polinukleotydowym RNA. RNaza A i RNaza H to dwie endorybonukleazy. RNaza A jest rybonukleazą trzustkową, która specyficznie rozszczepia niesparowane reszty cytozyny i uracylu na końcu 3 'jednoniciowego RNA przy wyższym stężeniu soli. RNaza H jest niespecyficznym enzymem rybonukleazy, który może degradować RNA w hybrydzie RNA-DNA poprzez reakcję hydrolityczną. To jest różnica między RNazą A i RNazą H.
Pobierz plik PDF RNASE A vs RNASE H
Możesz pobrać wersję PDF tego artykułu i używać jej w trybie offline, zgodnie z notą cytowania. Pobierz wersję PDF tutaj Różnica między RNASE A i RNASE H.
