Kluczowa różnica między mikrojądrem a makronukleusem polega na tym, że mikrojądro to mniejsze jądro zawierające genom linii zarodkowej pierwotniaków orzęskowych, podczas gdy makronukleus jest największym jądrem zawierającym genom somatyczny pierwotniaków orzęsków.
Dymorfizm jądrowy to zjawisko występowania dwóch różnych typów jąder w tej samej komórce. Jest to szczególna cecha występująca w orzęskach pierwotniaków i niektórych otwornicach. Te dwa jądra to makrojądro i mikrojądro. Zawierają oddzielne genomy. Makrojądro to większe, które kontroluje metabolizm pierwotniaków orzęskowych, podczas gdy mikrojądro jest mniejszym, które pełni funkcje reprodukcyjne i generuje makrojądro.
