Kluczowa różnica między CFC i HCFC polega na tym, że CFC zawiera tylko atomy węgla, fluoru i chloru, podczas gdy HCFC zawiera atomy wodoru, węgla, fluoru i chloru. Co ważniejsze, CFC powoduje poważne zubożenie warstwy ozonowej, ale HCFC ma stosunkowo mniejszy wpływ na warstwę ozonową.
Struktury chemiczne CFC i HCFC są ze sobą powiązane według pierwiastków chemicznych obecnych w tych strukturach. Jednak jeśli chodzi o budowę chemiczną, różnica między CFC i HCFC polega na tym, że CFC nie ma atomu wodoru, podczas gdy HCFC zawiera atom wodoru. CFC jest dobrze znanym czynnikiem przyczyniającym się do zubożenia warstwy ozonowej. Dlatego jest substancją szkodliwą. HCFC jest dobrym substytutem tej szkodliwej substancji.