Kluczową różnicą między hialoplazmą a cytozolem jest brak i obecność organelli komórkowych. Hialoplazma składa się z płynu bez struktury, podczas gdy cytozol składa się z płynu i ustrukturyzowanych organelli.
Hialoplazma i cytozol są organicznymi substancjami płynnymi znajdującymi się w komórce. Można je zaobserwować również w komórkach prokariotycznych, które są komórkami eukariotycznymi. Hialoplazma odnosi się do ciekłej części cytozolu, która nie zawiera żadnych struktur. Dla porównania cytosol jest fazą ciekłą, która składa się z elementów strukturalnych komórki poza jądrem.