Kluczowa różnica między kanałami jonowymi bramkowanymi napięciem i ligandami polega na tym, że kanały jonowe bramkowane napięciem otwierają się w odpowiedzi na różnicę napięcia, podczas gdy kanały bramkowane ligandem otwierają się w odpowiedzi na wiązanie liganda.
Transport błonowy jest ważnym mechanizmem, który umożliwia jonom wnikanie i uwalnianie komórki. Zatem kanały jonowe są ważnymi cząsteczkami, które pomagają w transporcie błonowym. Niemniej jednak większość kanałów jonowych jest osadzona w błonie komórkowej i są to białka. Jednak niektóre mogą być białkami kanałowymi, podczas gdy inne są nośnikami. Białka kanałowe są dwojakiego rodzaju; kanały bramkowane lub kanały nieobramowane. Bramkowane kanały jonowe są trzy rodzaje; mianowicie kanały jonowe bramkowane napięciem, bramkowane ligandem i aktywowane stresem. Strona wejściowa obu tych kanałów normalnie istnieje jako zamknięta i otwierają się tylko w określonych warunkach.
