Kluczowa różnica między kapsydem a kapsomerem polega na tym, że kapsyd jest otoczką białkową, która otacza i chroni genom wirusa, podczas gdy kapsomer jest strukturalną podjednostką kapsydu wirusa i agregacją kilku protomerów jako jednostki.
Wirusy są pasożytami wewnątrzkomórkowymi. Wszystkie są zakaźne i powodują różnego rodzaju choroby roślin, zwierząt, protistów, bakterii i grzybów. Istnieją dwa główne składniki, które tworzą wirusa. Są to otoczka białkowa i genom kwasu nukleinowego. Powłoka białkowa, znana również jako kapsyd, składa się z białek. Główną funkcją kapsydu jest ochrona genomu wirusa i pomoc w procesie infekcji. Kapsyd składa się z kapsomerów, które są strukturalnymi i morfologicznymi podjednostkami kapsydu wirusa. Kapsomery ładnie się samoistnieją i nadają kształt kapsydowi wirusa w każdej cząsteczce wirusa. Strukturalnie kapsomer jest agregacją kilku protomerów jako jednostki.