Kluczową różnicą między studzienką agarową a metodą dyfuzji krążkowej jest to, że w metodzie dyfuzji studni agarowej roztworem ekstraktu wlewa się otwór lub studzienkę utworzoną na podłożu agarowym, podczas gdy w metodzie dyfuzyjnej krążka agarowego krążek z bibuły filtracyjnej zawiera roztwór testowy. umieścić na powierzchni agaru.
Mikroorganizmy są czynnikami wielu chorób. Istnieją różne środki przeciwdrobnoustrojowe, które zabijają mikroorganizmy i hamują lub zatrzymują ich wzrost. Dostępne są różne metody przesiewowe i oceniające do wykrywania aktywności przeciwdrobnoustrojowej. Wśród nich metoda dyfuzyjna w studni agarowej i metody dyfuzyjne na krążku agarowym są powszechnie stosowanymi metodami analizy in vitro, które są metodami dyfuzyjnymi na agarze. Metody te są szeroko stosowane, ponieważ nie wymagają określonego sprzętu i dalszej oceny pod kątem odtwarzalności i standaryzacji. Obie metody zależą od dyfuzji środka przeciwdrobnoustrojowego przez podłoże agarowe.