Kluczową różnicą między prostaglandynami i leukotrienami jest to, że prostaglandyny są wytwarzane przez wszystkie typy komórek i wszystkie części ciała, które radzą sobie z urazami i chorobami, podczas gdy leukotrieny są wytwarzane przez leukocyty.
Eikozanoidy to rodzina bioaktywnych mediatorów lipidowych. Są to utlenione 20-węglowe kwasy tłuszczowe syntetyzowane z niezbędnych kwasów tłuszczowych w diecie. Biorą udział w regulacji szeregu reakcji fizjologicznych i patologicznych. Ponadto wykazują silne właściwości zapalne i pomagają w rozwoju i regulacji odpowiedzi immunologicznej i zapalnej. Prostaglandyny i leukotrieny to dwa rodzaje eikozanoidów otrzymywane z kwasu arachidonowego. Prostaglandyny zwiększają wpływ histaminy i bradykininy na przepuszczalność naczyń, podczas gdy leukotrieny pośredniczą w akumulacji leukocytów podczas ostrego zapalenia.