Kluczowa różnica między zegarem biologicznym a rytmem okołodobowym polega na tym, że zegar biologiczny jest wrodzonym urządzeniem czasowym organizmu, składającym się z określonych cząsteczek, które oddziałują z komórkami w całym ciele, podczas gdy rytm okołodobowy to fizyczna, psychiczna i behawioralna zmiana, która następuje po cyklu dziennym.
Czujemy się senni w nocy, ale jesteśmy energiczni i nie śpimy przez cały dzień. Powodem tego jest biologiczny zegar dobowy. Zegar biologiczny jest naszym wrodzonym urządzeniem czasowym, które jest kontrolowane przez nasz mózg. Rytm okołodobowy to naturalny i wewnętrzny proces, który powtarza się mniej więcej co 24 godziny. Rytm dobowy może wpływać na cykl snu / czuwania. Każda tkanka i narząd w naszym ciele działa zgodnie z zegarem biologicznym i rytmem dobowym. System zegara dobowego jest istotnym czynnikiem regulującym prawie wszystkie fizjologiczne czynności naszego organizmu. Zaburzenia w systemie zegara dobowego mogą mieć poważne konsekwencje dla zdrowia ludzkiego.