Kluczowa różnica między pluripotencjalnymi a indukowanymi pluripotencjalnymi komórkami macierzystymi polega na tym, że pluripotencjalne komórki są niezróżnicowanymi komórkami macierzystymi (z zarodków itp.), Które mają naturalną zdolność różnicowania się w różne typy komórek, podczas gdy indukowane pluripotencjalne komórki macierzyste to somatyczne komórki dorosłe, które mają zostały genetycznie przeprogramowane, aby wykazywać cechy podobne do naturalnych pluripotencjalnych komórek macierzystych.
Komórka macierzysta to niezróżnicowana komórka, która ma wyjątkową zdolność do przekształcania się w różne lub wyspecjalizowane komórki. Ponadto istnieją trzy typy komórek macierzystych: jednopotencjalne, pluripotencjalne i multipotencjalne. Jeśli komórka macierzysta może różnicować się w jedną, wiele i we wszystkie typy komórek, jest ona nazywana odpowiednio jedno-, multipotencjalną lub pluripotencjalną komórką macierzystą. Spośród powyższych trzech typów, pluripotencjalne komórki macierzyste są ważne, ponieważ mogą różnicować się we wszystkie typy komórek. Pluripotencjalna embrionalna komórka macierzysta może rozwinąć się w całego człowieka.