Kluczowa różnica między endopeptydazą a egzopeptydazą polega na tym, że endopeptydaza rozrywa wiązania peptydowe w cząsteczkach białka, podczas gdy egzopeptydaza rozszczepia wiązania peptydowe na końcach cząsteczek białka.
Białka to ważne makrocząsteczki, które są niezbędne w większości reakcji biochemicznych zachodzących we wszystkich organizmach. Różne aminokwasy łączą się ze sobą i tworzą te białka. Ponadto enzymy katalizują hydrolizę białek z powrotem do aminokwasów. Są to specyficzne enzymy zwane proteazami lub peptydazami. Dlatego mają zdolność rozbijania łańcuchów peptydowych białek na aminokwasy. Ponadto peptydazy mogą być endopeptydazami lub egzopeptydazami.
