siRNA vs miRNA
RNA to bardzo ważne cząsteczki, które pomagają w budowaniu życia organizmów. Niedawno naukowcy odkryli małe RNA zwane interferencją RNA lub RNAi, które po transkrypcji działają, kontrolując ekspresję genów. Dwa główne typy małych RNA to mikro RNA lub miRNA i małe interferujące RNA lub siRNA. Te cząsteczki zasadniczo regulują ekspresję genów poprzez tłumienie genu docelowego. Zarówno miRNA, jak i siRNA mają bardzo podobne ścieżki biogenezy, chociaż istnieją między nimi pewne różnice. MiRNA i siRNA pochodzą z cząsteczek dsRNA. Dojrzałe miRNA są strukturalnie podobne do cząsteczek siRNA.
miRNA
Mikro RNA lub miRNA to małe cząsteczki RNA, które pośredniczą w końcowej kontroli translacyjnej regulacji genów. Deregulacja miRNA może prowadzić do raka i innych chorób. Dlatego właściwa regulacja informacji kodowanej w niekodującym regionie miRNA jest bardzo ważna w wielu podstawowych procesach komórkowych.
siRNA
siRNA są również określane jako krótkie interferujące lub wyciszające RNA i składają się z dwuniciowego RNA o 20 do 25 parach zasad. Główną rolą siRNA jest zakłócanie ekspresji określonych genów z komplementarnymi sekwencjami nukleotydów. siRNA składa się z krótkiego dwuniciowego RNA z fosforylowanymi końcami 5 'i hydroksylowanymi końcami 3' z dwoma wystającymi nukleotydami.
Jaka jest różnica między siRNA a miRNA?
• miRNA pochodzący z określonych loci genomowych, podczas gdy siRNA pochodzi z mRNA, transpozonów, wirusów lub heterochromatycznego DNA.
• Synteza miRNA jest przetwarzana z dłuższych prekursorowych transkryptów spinki do włosów (pierwotna sekwencja jądrowego miRNA przez endonukleazę RNase III), podczas gdy siRNA jest przetwarzany z długich dwucząsteczkowych dupleksów RNA.
• Każda cząsteczka prekursora spinki do włosów miRNA wytwarza pojedynczy dupleks miRNA, podczas gdy każda cząsteczka prekursora siRNA wytwarza wiele dupleksów siRNA.
• Sekwencje siRNA są rzadko konserwowane, podczas gdy sekwencje miRNA są dobrze konserwowane.
• Wszystkie zasady w siRNA przyczyniają się do jego specyficzności docelowej, podczas gdy tylko 5 'połowa miRNA przyczynia się do jego specyficzności docelowej.
• miRNA często wiąże się z nieulegającym translacji regionem 3 'docelowych transkryptów, podczas gdy siRNA tworzą komplementarny dupleks w dowolnym miejscu na docelowym mRNA.
• miRNA określa „heterosilencing”, podczas gdy siRNA jest używane do „automatycznego wyciszania”.
• miRNA działa jako sygnał zapobiegający translacji, podczas gdy siRNA fizycznie zapobiega translacji.
