Kluczowa różnica między kariotypem a idiogramem polega na tym, że kariotyp to rzeczywisty obraz wszystkich chromosomów komórki, podczas gdy idiogram to schematyczny diagram kariotypu, który ilustruje wszystkie mapy chromosomów.
Zestaw chromosomów reprezentuje genom i informację genetyczną organizmu. Każdy chromosom ma unikalny kształt, rozmiar i zestaw genów. Liczba i fizyczne struktury chromosomów dostarczają ważnych informacji o organizmie. Kariotyping to technika wykonywana w celu zbadania pełnego zestawu chromosomów w komórce. Podczas tego testu zbiera się i analizuje całą liczbę chromosomów, aby określić, czy występują nieprawidłowości numeryczne lub strukturalne w chromosomach. Rzeczywisty obraz przedstawiający całkowitą liczbę chromosomów komórki to kariotyp, podczas gdy schematyczny diagram wszystkich chromosomów komórki to idiogram. Obie są ważne w badaniach cytogenetycznych.