Kluczowa różnica między sztucznym bliźniaczym embrionem a transferem jądra komórki somatycznej polega na tym, że sztuczne bliźniacze zarodki to technika, w której rozszczepienie zapłodnionego jajeczka na dwa identyczne genetycznie zarodki odbywa się w warunkach in vitro, podczas gdy transfer jądra komórki somatycznej jest techniką, w której z jądra komórki somatycznej do wyłuszczonej komórki jajowej zachodzi w warunkach in vitro.
Klonowanie molekularne jest ważną techniką wytwarzania organizmów rekombinowanych o ulepszonych cechach. Sztuczne bliźniacze embrionów i transfer jądra komórki somatycznej to dwie takie techniki stosowane w warunkach in vitro do tworzenia klonów zarówno do celów reprodukcyjnych, jak i terapeutycznych. Istnieje jednak różnica między bliźniaczymi sztucznymi embrionami a transferem jądra komórki somatycznej pod względem metody ich klonowania.
