Kluczowa różnica między hybrydyzacji międzygatunkowej i wewnątrzgatunkowej że międzygatunkowa hybrydyzacja zachodzi pomiędzy dwoma powiązanymi osób należących do dwóch różnych gatunków, podczas gdy wewnątrzgatunkowa hybrydyzacja zachodzi pomiędzy genetycznie rozbieżnych dwoma osobnikami tego samego gatunku.
Hybrydyzacja to proces kojarzenia się lub krzyżowania genetycznie zróżnicowanych osobników lub grup. Głównym celem hybrydyzacji jest połączenie pożądanych genów obecnych w różnych organizmach. Ponadto hybrydyzację stosuje się do produkcji potomstwa czystorasowego. Krycie można przeprowadzić między dwoma osobnikami tego samego gatunku lub między dwoma osobnikami różnych gatunków. Na tej podstawie wyróżnia się dwa typy hybrydyzacji: hybrydyzację wewnątrzgatunkową i hybrydyzację międzygatunkową.