Kluczową różnicą między prążkowaniem chromosomów a malowaniem chromosomów jest to, że prążkowanie chromosomów jest techniką barwienia, która wyświetla regiony chromosomów w rozróżnialnych ciemnych i jasnych pasmach, ale malowanie chromosomów jest techniką hybrydyzacji, w której określone regiony lub segmenty chromosomów są pomalowane specyficznymi dla sekwencji sondy znakowane fluorescencyjnie.
W cytogenetyce konieczne jest wytworzenie widocznego kariotypu organizmu w celu identyfikacji chromosomów i ich aberracji. Prążkowanie chromosomów i malowanie chromosomów to dwie techniki cytogenetyczne, które pomagają w wizualizacji chromosomów. Obie techniki są przydatne w identyfikacji zaburzeń genetycznych.
