Kluczowej różnicy między sinicami a proteobakteriami nie można konkretnie wywnioskować. Jednak cyjanobakterie, znane jako niebiesko-zielone algi, są całkowicie fotosyntetyczne, podczas gdy proteobakterie składają się z szerokiej gamy organizmów Gram-ujemnych, z których niektóre organizmy są fotosyntetyczne.
Mimo że sinice i proteobakterie mają wiele wspólnych cech, ze względu na ich zdolność do fotosyntezy, mogą się one od siebie różnić. Jednak oba są organizmami ważnymi dla przemysłu, jak również organizmami chorobotwórczymi.