Kluczową różnicą między motywem a domeną jest to, że motyw nie jest niezależnie stabilny, podczas gdy domena jest niezależnie stabilna.
Białka to ważne makrocząsteczki biologiczne obecne w naszym organizmie. Z drugiej strony, kod genetyczny genu będzie decydował o sekwencji aminokwasów białka. Ponadto białka mają strukturę pierwszorzędową, drugorzędową i trzeciorzędową. Podstawową strukturą jest sekwencja aminokwasów łańcucha polipeptydowego. Kiedy łańcuchy polipeptydowe zwijają się ze sobą, tworzy drugorzędową strukturę białka. Helisy alfa, arkusze beta i struktury super-drugorzędne należą do struktur drugorzędnych. Pewne grupy elementów super drugorzędnych są znane jako motywy białkowe. Trzeciorzędowa struktura białka odnosi się do jego trójwymiarowej struktury, która decyduje o funkcji białka. Domena to pofałdowana część cząsteczki białka, która jest kulista i pełni odrębną funkcję. Jest to podstawowa funkcjonalna i trójwymiarowa struktura białka.
