Kluczowa różnica między łodygą a pniem polega na tym, że łodyga zwykle odnosi się do głównej osi strukturalnej rośliny, podczas gdy pień zwykle odnosi się do głównej osi strukturalnej drzewa.
Łodyga i pień to dwie nazwy botaniczne używane czasami w podobnym znaczeniu. Ściśle mówiąc, istnieje pewna różnica między łodygą a pniem. Eksperci botaniki, biologii roślin i biotechnologii roślin twierdzą, że pień to nie tylko łodyga, ale także główna łodyga drzewa. Z tego wyjaśnienia rozumiemy, że to, co jest łodygą rośliny, jest pniem drzewa. Dlatego można powiedzieć, że słowo „pień” jest używane w odniesieniu do drzewa, podczas gdy słowo „łodyga” jest używane w odniesieniu do rośliny.