Kluczowa różnica między orbitalami hybrydowymi i zdegenerowanymi polega na tym, że orbitale hybrydowe to nowe orbitale, które powstają z mieszania dwóch lub więcej orbitali, podczas gdy zdegenerowane orbitale pierwotnie istnieją w atomie.
Jak sama nazwa wskazuje, orbital hybrydowy to hybryda dwóch lub więcej orbitali. Chociaż nazwa zdegenerowany orbital wydaje się taka sama, nie są to nowo utworzone orbitale - istnieją już w atomie. Co więcej, wszystkie orbitale hybrydowe w cząsteczce mają tę samą energię, podczas gdy zdegenerowane orbitale w atomie mają tę samą energię.