Różnica między Embden Meyerhof Pathway i Entner Doudoroff Pathway polega na tym, że Embden Meyerhof Pathway jest klasyczną glikolizą, która przekształca glukozę w pirogronian u eukariontów i wielu prokariotów. Jednocześnie ścieżka Entnera Doudoroffa jest alternatywną drogą glikolizy u nielicznych bakterii i przekształca glukozę w pirogronian w celu wytworzenia ATP.
Glikoliza jest pierwszym etapem oddychania komórkowego, podczas którego glukoza przekształca się w pirogronian. Podczas glikolizy zachodzi szereg reakcji. Generuje również dwie cząsteczki ATP jako produkcję netto. Szlak Embden Meyerhof jest synonimem glikolizy. glikoliza zachodzi u eukariontów i wielu prokariotów, które wykorzystują glukozę do wytwarzania ATP. Ale u niektórych prokariotów, szczególnie u niektórych bakterii, istnieje alternatywa dla glikolizy. Ta ścieżka jest znana jako ścieżka Entnera Doudoroffa. Zatem szlak Entnera Doudoroffa zastępuje klasyczną glikolizę w kilku typach bakterii.