Kluczową różnicą między tiocyjanianem a izotiocyjanianem jest to, że tiocyjanian jest grupą funkcyjną, w której grupa alkilowa lub arylowa jest przyłączona przez atom siarki, podczas gdy izotiocyjanian jest izomerem łączącym tiocyjanianu, w którym grupa alkilowa lub arylowa jest przyłączona przez atom azotu.
Tiocyjanian i izotiocyjanian to grupy funkcyjne zawierające atomy węgla, azotu i siarki. Te grupy funkcyjne mają taką samą łączność atomów. Oznacza to, że atom węgla znajduje się pośrodku, a atomy azotu i siarki są przyłączone do jego boków. Jednak wiązania chemiczne między tymi atomami różnią się od siebie.
