Kluczowa różnica między HPLC w fazie odwróconej a HPLC z fazą normalną polega na tym, że HPLC z fazą odwróconą wykorzystuje niepolarną fazę stacjonarną i polarną fazę ruchomą, podczas gdy HPLC z normalną fazą wykorzystuje polarną fazę stacjonarną i mniej polarną fazę ruchomą.
HPLC z fazą normalną jest najstarszą techniką HPLC, którą Tswett zastosował w swoich rozdziałach ekstraktów roślinnych; użył kredy w szklanej kolumnie. To był klasyczny sposób chromatografii, który doprowadził do nazwania jej techniką „normalną”. Z drugiej strony HPLC z odwróconą fazą jest przeciwieństwem normalnej techniki, którą naukowcy opracowali ostatnio.
