Kluczowa różnica między genotoksycznością a mutagennością polega na tym, że genotoksyczność to zdolność substancji do wywoływania toksyczności na DNA / materiale genetycznym komórki, podczas gdy mutagenność to zdolność czynnika do powodowania mutacji.
Genotoksyczność i mutagenność to dwa podobne terminy, często błędnie interpretowane i używane zamiennie przez ludzi. Genotoksyczność to toksyczny wpływ substancji chemicznej lub czynnika na geny lub DNA komórki. Tak więc substancją chemiczną o działaniu genotoksycznym jest genotoksyna. Natomiast mutagenność to zdolność substancji do wywoływania lub indukowania mutacji. Genotoksyczna substancja chemiczna niekoniecznie jest substancją mutagenną. Mogą być mutagenami. Jednak wszystkie czynniki mutagenne są genotoksyczne, ponieważ mają właściwości niszczenia materiału genetycznego komórki.